По официальным данным, БоГЭС окажет воздействие на окружающую среду на территории площадью 18 тыс. кв. км. На этом участке выявлено 151 месторождение и проявление ископаемых. Зона затопления гидроэлектростанции составляет 2 тыс. кв. км.
В зоне затопления Богучанской ГЭС окажется 59 месторождений торфа, глины, строительных камней и т. д. Как сообщает “Телеинформ”, ссылаясь на заместителя директора, заведующего отделом территориального комплексного кадастра природных ресурсов ГПКК «Красноярский научно-исследовательский институт геологии и минерального сырья» (КНИИГиМС) Владимир Грищенко, полезных ископаемых в зоне затопления не оказалось. В это верится с трудом.
Подтопленным в результате запуска БоГЭС окажется Вереинский участок Жеронского месторождения каменного угля, где в настоящее время ведется добыча. Подтопление составит 8-10% его площади, что, по мнению специалистов, приведет к финансовым потерям.
Ученые отмечают, что при заполнении водохранилища возможно всплытие торфяника. Для устранения последствий этого предполагается оставлять торфяные острова в затонах. В разработанной оценке воздействия на окружающую среду (ОВОС) предусмотрены работы по утилизации торфа.